More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2140 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  628  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1798  LysR family transcriptional regulator  84.12 
 
 		 302 aa  525  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2079  LysR family transcriptional regulator  83.78 
 
 		 302 aa  525  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1346  LysR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 302 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  37.29 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3588  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 319 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 311 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.93 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 319 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1336  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0531475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  33.66 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  35.66 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  35.25 
 
 		 319 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1375  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0224  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0362  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 320 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6567  hydrogen peroxide-inducible genes activator protein  35.43 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  hitchhiker  0.00672743 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  35 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  34.1 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  34.64 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  34.02 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 331 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0639  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1422  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  36.18 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4602  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  35.35 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  34.59 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  35.02 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1922  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1157  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5357  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.164156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5218  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5309  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0164  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.474897  normal  0.112541 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  34.22 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0382  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  32.67 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0202  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.3 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.89 
 
 		 311 aa  182  8.000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2339  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 308 aa  181  9.000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.111299  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0324  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0489134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4242  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1181  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113734  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1258  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000142134  normal  0.057719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1225  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128193  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2780  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>