More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1798 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1798  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2079  LysR family transcriptional regulator  98.67 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  84.12 
 
 		 303 aa  525  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1346  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 302 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 312 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3588  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300751  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  36.18 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 316 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 318 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  37.2 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1375  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58375  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1336  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0531475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0224  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 312 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  35.27 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2432  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0362  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0678  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  34.58 
 
 		 319 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2542  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.42186  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  34.58 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4389  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0020  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  33.11 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0382  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1422  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2953  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3739  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.717698  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48440  Transcriptional regulator, LysR family protein  33.22 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0556278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6567  hydrogen peroxide-inducible genes activator protein  35.88 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  hitchhiker  0.00672743 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2522  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0196222  normal  0.718346 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  36.05 
 
 		 311 aa  182  6e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0368  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.257927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0377  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0017  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.163482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2948  transcriptional regulator, LysR family protein  32.76 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.190207  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1328  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  34.29 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4602  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3833  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  33.93 
 
 		 296 aa  179  4e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4242  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1225  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00128193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  35.03 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0594  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1181  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00113734  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1258  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000142134  normal  0.057719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2334  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.618914 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5771  transcriptional regulator LysR family  34.38 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  33.33 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3046  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.295225 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3132  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000319195  normal  0.475584 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3802  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.238076  normal  0.337014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1013  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0736859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  34.69 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0472  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3053  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.979958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2780  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.763495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2868  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000208433  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2950  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5250  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 313 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0066  oxidative stress regulatory protein OxyR, putative  32.07 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>