More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4591 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  66.1 
 
 		 292 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  65.17 
 
 		 292 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1340  putative transcriptional regulator  57.88 
 
 		 302 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15240  LysR family transcriptional regulator  57.88 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000000000510266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1939  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000010986  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5230  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 293 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208833  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3313  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5054  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0609  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 294 aa  159  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 302 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  34.2 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 304 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 290 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4070  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.409277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  35.61 
 
 		 295 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  37.55 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  37.55 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3524  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.76062  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  34.9 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6068  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6552  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392727 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5704  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  32.64 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4431  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 291 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  34.02 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6844  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  32.66 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1900  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 300 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 307 aa  135  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  33.83 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  33.83 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  33.83 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  34.01 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  33.83 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4819  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4256  DNA-binding transcriptional activator XapR  32.13 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  32.77 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  34.27 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  29.55 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0256  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 293 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>