More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0609 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0609  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5230  LysR family transcriptional regulator  88.62 
 
 		 293 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208833  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3313  LysR family transcriptional regulator  88.62 
 
 		 293 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5054  LysR family transcriptional regulator  88.62 
 
 		 293 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 301 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4591  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1939  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000010986  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1340  putative transcriptional regulator  42.52 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1028  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 292 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1068  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1026  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15240  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000000000510266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  35.11 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  35.11 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  35.11 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  36.26 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  34.98 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1400  LysR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 303 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  36.94 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  35.51 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4819  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.58153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 296 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1291  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3228  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4305  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.201551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  32.73 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  34.56 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3085  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  34.93 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  33.82 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3076  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1719  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.553027  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3084  transcriptional regulator, LysR family  33.59 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  32.2 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  31.34 
 
 		 298 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0445  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04822  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05669  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1156  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4256  DNA-binding transcriptional activator XapR  29.86 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318562 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  34.02 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3013  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 295 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4944  LysR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  30.35 
 
 		 310 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 302 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5071  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>