More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2847 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2847  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2560  transcriptional regulator, LysR family  75.9 
 
 		 325 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000128008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  41.79 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 331 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06400  transcriptional regulator  41 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.450023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1381  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 300 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0155943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0112  transcriptional regulator, LysR family  37.85 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.262181  normal  0.0290414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4722  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0790  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156253  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0641  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4901  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5618  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000121214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5069  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5454  LysR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4914  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 294 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5335  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5310  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1453799999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5392  transcriptional regulator, LysR family  28.04 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5341  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5012  LysR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 294 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3362  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0184586  normal  0.124308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1383  transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4029  transcriptional regulator, LysR family  32.95 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1275  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  30.68 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 303 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3565  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.116622  normal  0.0782096 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1225  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 290 aa  96.3  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  30.04 
 
 		 299 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 296 aa  95.9  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1774  transcriptional regulator CysB-like protein  26.76 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19930  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  26.03 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3378  transcriptional regulator, LysR family  31.17 
 
 		 306 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.587515  normal  0.118229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4128  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 315 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  29.96 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  30.77 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0157  transcriptional regulator, LysR family  34.4 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03270  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  28.69 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  28.74 
 
 		 317 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1575  transcriptional regulator, LysR family  25.1 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381269  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.18 
 
 		 295 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.09 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 311 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  29.93 
 
 		 298 aa  90.1  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4011  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  29.31 
 
 		 290 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4130  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  29.31 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3936  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  29.31 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4033  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  29.31 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.57 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 298 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2840  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 322 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 301 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3616  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  28.45 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0139  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  27.54 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0354  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  29.61 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4350  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  28.88 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 312 aa  87  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>