More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3936 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4130  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  100 
 
 		 290 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4011  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  99.66 
 
 		 290 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3936  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  100 
 
 		 290 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4033  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  100 
 
 		 290 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3616  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  95.52 
 
 		 290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0360  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  92.07 
 
 		 290 aa  558  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3666  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  91.72 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.832563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0354  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  91.72 
 
 		 290 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4350  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  90.69 
 
 		 290 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0343  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  75.86 
 
 		 290 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0420  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  74.83 
 
 		 290 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4167  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  76.55 
 
 		 290 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0440  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  76.21 
 
 		 290 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0287  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  74.22 
 
 		 294 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125086 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3416  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  72.13 
 
 		 293 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  69.31 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0855  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.92 
 
 		 293 aa  332  3e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4840  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  54.11 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00477  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 304 aa  312  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4752  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  54.67 
 
 		 304 aa  311  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2549  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.512449  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0162  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.24 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0492  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.24 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0543083  normal  0.0296951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4052  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.24 
 
 		 293 aa  306  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4010  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 296 aa  304  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4148  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.384432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3769  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.923238  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03651  DNA-binding transcriptional dual regulator  52.22 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0064932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4203  transcriptional regulator, LysR family  52.22 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4118  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4138  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4022  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.54 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4229  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03600  hypothetical protein  52.22 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3991  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4190  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4133  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4239  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 295 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5207  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4298  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 295 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4214  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.19 
 
 		 296 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0145  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.9 
 
 		 295 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001984  HTH-type transcriptional regulator IlvY  48.44 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0086  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.24 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04020  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.77 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.057098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4254  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  44.98 
 
 		 284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1008  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  42.76 
 
 		 293 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0484713  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0503  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  43.84 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000330377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2757  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  42.01 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3845  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  40.4 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  decreased coverage  0.0000000043089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2540  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  42.61 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2519  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  40.91 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1484  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  41.26 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000079886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  29.8 
 
 		 299 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  28.05 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5534  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162022  normal  0.470463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3899  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3927  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 303 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  24.57 
 
 		 298 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  25.6 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1733  LysR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  28.17 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3047  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 296 aa  92.8  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.229406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2077  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5293  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.382002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  27.06 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4149  LysR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.438214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>