More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3769 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3769  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  100 
 
 		 295 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.923238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0145  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  89.49 
 
 		 295 aa  511  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4214  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  84.35 
 
 		 296 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4022  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  85.03 
 
 		 296 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4752  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  80.2 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4052  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  77.82 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0162  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  77.82 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0492  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  77.82 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0543083  normal  0.0296951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4010  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  72.01 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4118  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.77 
 
 		 295 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03651  DNA-binding transcriptional dual regulator  71.33 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0064932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4203  transcriptional regulator, LysR family  71.33 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.33 
 
 		 296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4239  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.67 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4148  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.33 
 
 		 296 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.384432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3991  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.33 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4133  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.67 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4229  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.33 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4298  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  72.01 
 
 		 295 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4190  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.67 
 
 		 295 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03600  hypothetical protein  71.33 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4138  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  71.33 
 
 		 296 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5207  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  70.99 
 
 		 297 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4840  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.92 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4350  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.24 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0354  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.58 
 
 		 290 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0360  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.58 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3666  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.58 
 
 		 290 aa  325  5e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.832563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3616  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.24 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0343  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.56 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0287  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.38 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4011  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3936  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 290 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4033  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 290 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4130  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 290 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0855  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.9 
 
 		 293 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0420  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 290 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3416  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.25 
 
 		 293 aa  311  9e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0440  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.22 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4167  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.54 
 
 		 290 aa  309  5e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.6 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00477  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.15 
 
 		 304 aa  301  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001984  HTH-type transcriptional regulator IlvY  47.8 
 
 		 296 aa  294  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2549  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.1 
 
 		 298 aa  290  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.512449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4254  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  48.45 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0086  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  44.29 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04020  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.22 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.057098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1008  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  45.05 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0484713  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1484  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  41.55 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000079886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2757  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  40.88 
 
 		 326 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3845  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  43.38 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  decreased coverage  0.0000000043089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0503  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  45.27 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000330377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2519  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  40.2 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2540  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  40.54 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  30.46 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 300 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.78 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  31.2 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4970  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 298 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1408  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.185298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1374  LysR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 335 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3561  LysR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  31.89 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  30.74 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  28.47 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2215  transcriptional regulator, LysR family  31.92 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  25.82 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>