More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00477 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00477  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  100 
 
 		 304 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001984  HTH-type transcriptional regulator IlvY  88.81 
 
 		 296 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2549  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  73.97 
 
 		 298 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.512449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0086  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  62.93 
 
 		 294 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0354  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.74 
 
 		 290 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4350  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.08 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3666  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.74 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.832563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0360  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.74 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3616  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.87 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0420  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.83 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4033  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3936  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4130  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4011  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 290 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4752  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.83 
 
 		 304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0855  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.83 
 
 		 293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0145  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 295 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.3 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3416  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.7 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0343  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.31 
 
 		 290 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0492  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.34 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0543083  normal  0.0296951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4052  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.34 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0162  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.34 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3769  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.15 
 
 		 295 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.923238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4214  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.94 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0440  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.4 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4022  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.26 
 
 		 296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4167  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.75 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4118  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.78 
 
 		 295 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4010  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 296 aa  277  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4298  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 295 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03651  DNA-binding transcriptional dual regulator  47.26 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0064932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4203  transcriptional regulator, LysR family  47.26 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4229  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4148  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.384432  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4138  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03600  hypothetical protein  47.26 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3991  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0287  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.5 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4840  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.53 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5207  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.26 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4133  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.92 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4190  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.92 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4239  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  46.92 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0503  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.4 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000330377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4254  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  43.9 
 
 		 284 aa  263  4e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2540  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  42.18 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04020  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  43.75 
 
 		 290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.057098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3845  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  44.71 
 
 		 297 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  decreased coverage  0.0000000043089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1008  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  42.56 
 
 		 293 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0484713  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2757  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  39.26 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1484  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  37.63 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000079886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2519  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  36.52 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1899  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.690335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  25.47 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0586  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.364179  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0821  LysR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0342019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0412  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0159161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3973  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  29.27 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3036  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000194633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 305 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1477  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 314 aa  92.4  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.490418  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0400  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  25.96 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0699  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3757  LysR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2069  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  25.09 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>