More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6198 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  590  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 330 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 312 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.12 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  42.12 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  41.76 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 295 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 297 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  38.26 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 296 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.06 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  38.2 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  41.86 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  38.2 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 303 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 321 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  42.55 
 
 		 317 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  40.54 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  42.55 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 300 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  39.85 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  38.15 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  39.11 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 297 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  37.1 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 295 aa  162  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  38.46 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>