More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2558 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  91.33 
 
 		 321 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  58.84 
 
 		 297 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  44.98 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3136  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  41.18 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 298 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 301 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 302 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.12 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5369  putative LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  39.1 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  38.54 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  39.79 
 
 		 317 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 317 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 299 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.57 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  41.1 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>