More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3044 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  607  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  78.31 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  77.63 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 298 aa  333  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 304 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 302 aa  301  8.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  51.55 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  46.31 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 302 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 304 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 296 aa  280  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 295 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 300 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  44.67 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 296 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 296 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 297 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  46.38 
 
 		 314 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 298 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 303 aa  235  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 300 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 317 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  46.05 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  41.78 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.28 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  41.69 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 294 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 293 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 297 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0772  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.162438  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 318 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 297 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>