More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2537 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  622  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  49.83 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  52.4 
 
 		 297 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 294 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 294 aa  272  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  51.71 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  51.71 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 296 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 304 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  49.14 
 
 		 296 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  48.11 
 
 		 317 aa  258  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  48.11 
 
 		 317 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 310 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  51.01 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 294 aa  247  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  44.22 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 300 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  51.09 
 
 		 314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  48.8 
 
 		 316 aa  238  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 300 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  41.41 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 295 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  45.73 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  42.46 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  42.42 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  42.12 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 308 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 296 aa  211  9e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.27 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 315 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  40.36 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0778  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>