More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0715 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 293 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  64.04 
 
 		 293 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0772  LysR family transcriptional regulator  62.15 
 
 		 294 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.162438  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  52.58 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  48.64 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  47.26 
 
 		 296 aa  275  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  46.88 
 
 		 294 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 298 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 298 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  47.6 
 
 		 317 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  47.26 
 
 		 317 aa  251  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 295 aa  244  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  41.78 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 297 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 296 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 294 aa  235  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  48.07 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  47.02 
 
 		 296 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  47.02 
 
 		 297 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 298 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 305 aa  231  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 303 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  44.03 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 300 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  39.86 
 
 		 298 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 296 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  41.38 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  45.79 
 
 		 314 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 297 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.79 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2575  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0778  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 296 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>