More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2575 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2575  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  46.74 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  45.58 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  43.62 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 300 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 294 aa  208  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  43.59 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 296 aa  199  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4035  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 294 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  40.58 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 293 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  42.49 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  45.79 
 
 		 296 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  45.82 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 304 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  41.61 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  45.42 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3504  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0772  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.162438  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.27 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  40.66 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  42.65 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3810  LysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  40.15 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 304 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  35.77 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>