More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3995 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  50.17 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  54.11 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  51.7 
 
 		 296 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  53.77 
 
 		 317 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  51.72 
 
 		 296 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  48.62 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  53.08 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 298 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 301 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  46.59 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  46.95 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 298 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  42.55 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  43.42 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  45.21 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 296 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 294 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  39.59 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  40.55 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 295 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2575  LysR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.187832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  43.99 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0772  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.162438  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.8 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  38.57 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 297 aa  185  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  37.92 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  37.92 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>