More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3799 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  77.93 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  77.93 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  77.93 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  59.6 
 
 		 307 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 302 aa  356  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  55.82 
 
 		 295 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 294 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 294 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  47.78 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  51.55 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 297 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  51.2 
 
 		 298 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 294 aa  286  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 296 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 296 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  46.58 
 
 		 296 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  47.78 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  45.21 
 
 		 301 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 298 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.1 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  48.11 
 
 		 296 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  48.26 
 
 		 297 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 298 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  47.92 
 
 		 296 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  47.22 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  44.52 
 
 		 300 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  42.12 
 
 		 317 aa  248  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  46.39 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 298 aa  237  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 296 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  40.89 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 311 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  38.93 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 297 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  40.2 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 302 aa  222  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 297 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>