More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4274 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  94.61 
 
 		 297 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  94.26 
 
 		 296 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  78.04 
 
 		 310 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  78.84 
 
 		 296 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  73.13 
 
 		 294 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  64.86 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  55.44 
 
 		 294 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  55.44 
 
 		 294 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 294 aa  306  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  54.42 
 
 		 294 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 310 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  53.61 
 
 		 296 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  53.33 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  53 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 300 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  54.61 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 298 aa  279  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 298 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 300 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  48.8 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 298 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 298 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 301 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 294 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 293 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 298 aa  258  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 298 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  44.37 
 
 		 296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  46.39 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 293 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 297 aa  251  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0772  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 294 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.162438  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  47.95 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 294 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0778  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 296 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 296 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.05 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 300 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 330 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  42.33 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  41.94 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.07 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4518  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 303 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 302 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>