More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5095 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  597  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  75.34 
 
 		 301 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  73.09 
 
 		 306 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 302 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  59.72 
 
 		 307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  59.36 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  57.6 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  51.54 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 296 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  45.95 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  45.26 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  45.26 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 		 300 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.84 
 
 		 302 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  43.62 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 297 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  44.16 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3136  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  44.89 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  44.57 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  42.24 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 294 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  42.62 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 297 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  40.2 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  44.37 
 
 		 322 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  44.57 
 
 		 297 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  42.54 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  42.34 
 
 		 296 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 310 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 289 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 295 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  44.32 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  40.41 
 
 		 317 aa  198  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  39.56 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 297 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  37.73 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>