More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3228 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  634    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  97.48 
 
 		 312 aa  589  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  80.91 
 
 		 311 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  77.39 
 
 		 314 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  71.66 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 321 aa  433  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  68.52 
 
 		 315 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 302 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  50.5 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  47.26 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  47.26 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  52.1 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 308 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  50.88 
 
 		 311 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  47.99 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 294 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  48.68 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 304 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  48.63 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  47.02 
 
 		 304 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 317 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  44.98 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  45.21 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 301 aa  232  8.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  43.69 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  43.24 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  42.23 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  40.65 
 
 		 309 aa  225  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.18 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 295 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 304 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  43.49 
 
 		 296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 		 295 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.33 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  34.59 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 303 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 294 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 294 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  41.75 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 306 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  41.75 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 322 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  42.19 
 
 		 297 aa  209  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 303 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5537  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5902  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 306 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3136  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>