More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2873 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  594  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  99.66 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  84.59 
 
 		 301 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  70.1 
 
 		 294 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 309 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 296 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 296 aa  278  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.28 
 
 		 302 aa  257  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 318 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 321 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 299 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 295 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  43.31 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  43.34 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 295 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  43.86 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  41.5 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  38.7 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 294 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 296 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  40.33 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  40.33 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  37.8 
 
 		 305 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 303 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  37.25 
 
 		 300 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.67 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6198  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0517746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4035  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.216619 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>