More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0531 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  98.35 
 
 		 303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  81.85 
 
 		 300 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  80.14 
 
 		 298 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  80.14 
 
 		 298 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  78.77 
 
 		 298 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  79.11 
 
 		 298 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  79.11 
 
 		 298 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  78.91 
 
 		 298 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  57.73 
 
 		 294 aa  346  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  57.73 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  57.73 
 
 		 294 aa  342  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  56.01 
 
 		 297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  55.33 
 
 		 297 aa  334  9e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  57.04 
 
 		 296 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  54.76 
 
 		 296 aa  318  9e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 		 298 aa  318  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 301 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  52.33 
 
 		 317 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  52.33 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 294 aa  282  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  52.29 
 
 		 316 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 305 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  46.23 
 
 		 294 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 295 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  48.82 
 
 		 312 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 300 aa  262  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 295 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  49.14 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  49.14 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 293 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 296 aa  251  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  43.69 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  48.11 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 297 aa  242  7e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.33 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  47.3 
 
 		 314 aa  235  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 296 aa  235  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0778  LysR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 298 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4518  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  41.78 
 
 		 300 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  37.71 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 330 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  38.14 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  37.96 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>