More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2819 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  78.86 
 
 		 302 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 297 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  78.72 
 
 		 303 aa  464  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  57.19 
 
 		 298 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  56.51 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 302 aa  298  7e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 		 307 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 295 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  51.71 
 
 		 294 aa  288  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 295 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  51.37 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  51.37 
 
 		 294 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  49.65 
 
 		 296 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 294 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  49.14 
 
 		 296 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  47.44 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  49.16 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  48.82 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  47.78 
 
 		 296 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 303 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  48.15 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 297 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 298 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 297 aa  256  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 298 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  47.81 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  45.89 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  47.97 
 
 		 296 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 303 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 310 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 296 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 302 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  43.34 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 330 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  44.18 
 
 		 312 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.74 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 293 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  43.3 
 
 		 305 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  42.01 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.57 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  47.46 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 296 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>