More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0948 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 296 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  81.63 
 
 		 296 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  75.34 
 
 		 317 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  74.66 
 
 		 317 aa  424  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  73.97 
 
 		 316 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  62.89 
 
 		 294 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  62.54 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  62.54 
 
 		 294 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 298 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  59.79 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 303 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  55.82 
 
 		 300 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 298 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  56.7 
 
 		 301 aa  319  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  50.86 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 294 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  49.31 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 297 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  51.54 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 296 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  53.61 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  47.3 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 297 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  52.92 
 
 		 297 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  52.23 
 
 		 296 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 300 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 302 aa  255  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  42.71 
 
 		 298 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0686  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 294 aa  248  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 306 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  50.52 
 
 		 314 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  45.36 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4518  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  40.68 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0778  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 296 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.75 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 321 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 295 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>