More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4080 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  661    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 296 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  45.02 
 
 		 294 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 295 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 317 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 300 aa  231  9e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  43.81 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 308 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 307 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 294 aa  228  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 293 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 297 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5443  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.86 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 296 aa  222  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 301 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  42.39 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 311 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 297 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  41.78 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5246  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.89 
 
 		 311 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 312 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  41.24 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  41.24 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  39.06 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 294 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>