More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5443 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5443  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  36.24 
 
 		 294 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 295 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  33 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  38.69 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 295 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 296 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  38.99 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  38.11 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  33.45 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 293 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.45 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  37.86 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5246  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.13 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  34.31 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  36.96 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 294 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 309 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  36.13 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  31.84 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 301 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  37 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  31.64 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 303 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 296 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  36.23 
 
 		 314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>