More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0146 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
294 aa  587  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
294 aa  587  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  57.68 
 
 
294 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  55.63 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  55.63 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  54.76 
 
 
296 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  53.56 
 
 
303 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  53.56 
 
 
303 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  53.56 
 
 
303 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 
303 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  54.98 
 
 
296 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
298 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
298 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
298 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 
300 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  50.86 
 
 
317 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  53.08 
 
 
296 aa  285  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  53.08 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  50.86 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  53.42 
 
 
297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  52.4 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  50.52 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
303 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 
301 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
300 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
294 aa  275  7e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4874  transcriptional regulator, LysR family  52.23 
 
 
316 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.106591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
294 aa  271  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
310 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  45.05 
 
 
298 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  47.78 
 
 
303 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 
300 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  45.39 
 
 
298 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
302 aa  267  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
300 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
300 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
295 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  44.67 
 
 
295 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  48.73 
 
 
297 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 
293 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 
296 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43980  LysR family transcriptional regulatory protein  54.14 
 
 
314 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
296 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
296 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
296 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
296 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
296 aa  258  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0980  transcriptional regulator, LysR family  45.83 
 
 
297 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3330  transcriptional regulator, LysR family  45.83 
 
 
297 aa  258  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
306 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 
297 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 
293 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  46.23 
 
 
300 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 
293 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3102  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 
298 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
293 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  45.73 
 
 
312 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
298 aa  240  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 
295 aa  239  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2215  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
305 aa  235  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.554264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2457  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.513677  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0778  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0772  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 
294 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.162438  normal  0.780092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1291  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0519427  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 
297 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.78 
 
 
304 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 
295 aa  228  9e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 
300 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
327 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1632  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
300 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
297 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
297 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 
311 aa  221  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
297 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>