More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  54.85 
 
 		 300 aa  342  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  56.61 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  56.27 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 297 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  55.59 
 
 		 297 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  55.59 
 
 		 297 aa  328  6e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  45.79 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 301 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 301 aa  242  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  45.79 
 
 		 306 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  42.96 
 
 		 294 aa  232  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  42.56 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 315 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 304 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 296 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  43.29 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  44.03 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 318 aa  221  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 289 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  41.34 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  42.2 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  40.07 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  39.58 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 297 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 303 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  38.99 
 
 		 321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 308 aa  198  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.18 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  38.03 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.49 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3339  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.173943  normal  0.644256 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>