More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2252 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 296 aa  594  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.86 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 294 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 296 aa  230  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  42.66 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 		 296 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  41.3 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  38.14 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  40.35 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 304 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  41.34 
 
 		 307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  35.4 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  37.16 
 
 		 317 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5369  putative LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.269741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 302 aa  186  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5537  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5902  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.64 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  36.3 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 298 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>