More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0805 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 321 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  47.6 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 305 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  47.1 
 
 		 315 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  48.47 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  46.62 
 
 		 305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  46.44 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  45.27 
 
 		 301 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3136  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 307 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  43.99 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  41.36 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  43.31 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  41.16 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 296 aa  222  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 295 aa  221  8e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  43.15 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 		 307 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  42.03 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  42.37 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 297 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  38.57 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 297 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  38.7 
 
 		 312 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 299 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 303 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>