More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2354 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2354  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1755  transcriptional regulator, LysR family  71.8 
 
 		 305 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  70.67 
 
 		 300 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  70.33 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6247  LysR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2062  transcriptional regulator, LysR family  61.92 
 
 		 322 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.435121  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1124  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 306 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6614  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 305 aa  335  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0439  LysR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5983  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 302 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.95489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3136  LysR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 303 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  45.82 
 
 		 301 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 330 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 296 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  42 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 298 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 327 aa  185  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  37.76 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.96 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  35.45 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  35.43 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  35.79 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 297 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 302 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>