More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1644 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1644  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 		 295 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 295 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 294 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2873  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2360  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.612222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 309 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  44.63 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  41.22 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 304 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  41.22 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 299 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 299 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 297 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  39.38 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 289 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 302 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 321 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  38.83 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  36.49 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 297 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3044  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  39.38 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 294 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  38.89 
 
 		 295 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7247  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179007  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6962  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3144  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6037  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2491  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.499432  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1614  LysR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  hitchhiker  0.0000854951 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>