More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5537 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_5902  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5537  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  43.84 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  42.39 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  42.39 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 330 aa  195  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  41.67 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2537  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3901  transcriptional regulator  38.44 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.356442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  36.97 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2548  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1297  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634738  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2252  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2873  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 294 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  35.29 
 
 		 294 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3544  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  37.77 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1474  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2558  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3136  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0798912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  35.31 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1011  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 296 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0775106  normal  0.552509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0930  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1554  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0962  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.656034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1883  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0687382  normal  0.7379 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0991  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  34.6 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1507  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.8 
 
 		 304 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2389  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  36.63 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0286  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.794567 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0999  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165129  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  36.6 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>