More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0286 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0286  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  541  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.794567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2733  LysR family transcriptional regulator  55.6 
 
 		 289 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0391194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2126  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2109  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 301 aa  279  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00408036  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1040  transcriptional regulator, LysR family  53.31 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1196  DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  53.31 
 
 		 306 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1132  transcriptional regulator, LysR family  52.79 
 
 		 304 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3269  transcriptional regulator, LysR family  43.61 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0672409  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3607  LysR family transcriptional regulator  44.24 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3038  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  46.01 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  44.11 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4248  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 308 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1423  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26010  Transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1313  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2149  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 		 294 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5026  LysR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.508806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1224  LysR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.012159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2112  LysR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0163  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.132005  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0146  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2819  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.664113  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1443  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.808865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6978  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0150  transcriptional regulator, LysR family  41.13 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4035  LysR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 313 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0132  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1379  transcriptional regulator, LysR family  37.4 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.884009  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0586  LysR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2444  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.980277 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46470  LysR family regulatory protein  42.42 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4903  transcriptional regulator, LysR family  41.15 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  39.62 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0452  LysR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0948  transcriptional regulator, LysR family  41.73 
 
 		 296 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4490  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4270  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2579  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2581  transcriptional regulator, LysR family  43.82 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1387  LysR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123084  normal  0.109055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4032  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4752  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 317 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5234  LysR family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 314 aa  191  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.748961  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6597  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0290538  normal  0.188655 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4350  LysR substrate-binding  41.89 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.596165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2144  LysR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.262802  hitchhiker  0.00398502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1243  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3228  LysR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.075069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3649  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3767  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4601  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 298 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.829145  normal  0.12385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4718  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0423403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4526  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128293  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4045  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.603685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52920  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 298 aa  188  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5095  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2306  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.846399  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0704  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2024  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0238191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5582  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651433  hitchhiker  0.00527291 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2223  LysR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3799  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.353569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3890  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0174  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3598  LysR substrate-binding  38.19 
 
 		 297 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1931  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1654  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0607  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0715  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1724  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 303 aa  185  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1925  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.851659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1307  transcriptional regulator, LysR family  39.1 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1453  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0805  transcriptional regulator, LysR family  40.46 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4659  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  0.944933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1294  LysR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.652198  normal  0.118102 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6279  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4274  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.614973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4664  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1650  LysR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3872  LysR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1285  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0531  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0729988  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1037  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0260  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1377  LysR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3424  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>