More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0855 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0855  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  100 
 
 		 293 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3416  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.94 
 
 		 293 aa  341  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4840  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  55.33 
 
 		 292 aa  338  5.9999999999999996e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0420  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.58 
 
 		 290 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0360  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.61 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0354  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.61 
 
 		 290 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4011  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.26 
 
 		 290 aa  334  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0343  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.26 
 
 		 290 aa  334  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4350  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.26 
 
 		 290 aa  333  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3666  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.26 
 
 		 290 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.832563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4130  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.92 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3936  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.92 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4033  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.92 
 
 		 290 aa  332  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3616  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.26 
 
 		 290 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0287  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.39 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.125086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4167  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.92 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0440  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  53.47 
 
 		 290 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4752  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  52.6 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.66 
 
 		 292 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4214  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.56 
 
 		 296 aa  308  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3769  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.9 
 
 		 295 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.923238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4022  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.87 
 
 		 296 aa  305  8.000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0162  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0492  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0543083  normal  0.0296951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4052  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  51.88 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00477  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.83 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4118  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.83 
 
 		 295 aa  301  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0145  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 295 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2549  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.48 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.512449  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4298  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.52 
 
 		 295 aa  299  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001984  HTH-type transcriptional regulator IlvY  49.48 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4148  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 296 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.384432  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4133  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4239  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4190  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.942624  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03651  DNA-binding transcriptional dual regulator  50.17 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0064932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4203  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3991  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03600  hypothetical protein  50.17 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4229  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4283  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 296 aa  296  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5207  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  50.17 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4138  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.83 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0964994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4010  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  49.13 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.016258 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0086  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  47.39 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4254  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  45.86 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04020  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  44.44 
 
 		 290 aa  245  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.057098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2757  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  39.72 
 
 		 326 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1008  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  41.3 
 
 		 293 aa  235  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0484713  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2519  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  39.72 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3845  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  41.81 
 
 		 297 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  decreased coverage  0.0000000043089 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1484  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  39.02 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000079886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0503  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  44.07 
 
 		 293 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000330377  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2540  DNA-binding transcriptional regulator IlvY  40.28 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  25.75 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  29.73 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2193  transcriptional regulator, LysR family  23.15 
 
 		 292 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.35809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01483  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.41 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2120  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01494  hypothetical protein  27.41 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1608  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0551  transcriptional regulator, LysR family protein  29.01 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215454  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0943  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0121  transcriptional regulator, LysR family  26.74 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1646  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2139  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0856  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.252777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  26.48 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1668  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0844  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.033432 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3514  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0347689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4632  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  26.38 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4637  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1726  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1939  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 290 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.514267  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  28.51 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 295 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>