More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0943 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0943  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1975  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3479  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1358  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0449  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1189  transcriptional regulator, LysR family  32.25 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.544335 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27230  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1007  fhu operon transcription regulator  31.74 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000456933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18090  transcriptional regulator  28.52 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3114  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2850  LysR family substrate binding transcriptional regulator  28.14 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.46504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3264  transcriptional regulator, LysR family  27.99 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2959  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07300  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  29.51 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3038  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000600808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3271  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 290 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4662  LysR family substrate binding transcriptional regulator  29.47 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.14 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1664  LysR substrate-binding protein  35.38 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  29.9 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2736  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  28.14 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0464  transcriptional regulator, LysR family  31.5 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3155  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.921002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08730  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 303 aa  99.8  5e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  30.28 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.28 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1224  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4649  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.28 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.28 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  30.28 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  29.97 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  30.28 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3178  transcriptional regulator, LysR family  27.7 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3094  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.7 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.15 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2085  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 298 aa  96.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  33.02 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2948  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.871741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2921  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.493083  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3170  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 292 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1113  transcriptional regulator, LysR family  28.14 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1389  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02139  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3164  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00370809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 312 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5520  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.579894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5884  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.279758 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  32.62 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3176  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.594001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2431  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1730  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4934  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  27.52 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3226  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.96 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  30.26 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.87 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5024  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 311 aa  92  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0432035  normal  0.889367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  28.87 
 
 		 299 aa  92  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1896  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 296 aa  92.4  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 301 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1053  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262564  normal  0.905939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  24.74 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>