More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8824 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 316 aa  634    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  72.2 
 
 		 299 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 		 321 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  34.21 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4791  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 293 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3465  hypothetical protein  31.14 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3363  hypothetical protein  31.14 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.354704  normal  0.788969 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3370  hypothetical protein  31.14 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.562011  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  34.72 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 296 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7143  transcriptional regulator, LysR family  34.49 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.297032  normal  0.653171 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3379  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311743  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4988  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5299  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0530813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3491  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3296  StmR  30.8 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.618402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 296 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3612  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0639  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  34.39 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2265  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2155  LysR family substrate binding transcriptional regulator  32.43 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.971753  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3895  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 292 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  34.69 
 
 		 295 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3345  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 300 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.06 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3228  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3948  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 291 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  33.71 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3076  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4411  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0509478  normal  0.98744 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2326  LysR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3404  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.729223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0834  LysR, substrate-binding  32.85 
 
 		 330 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  29.31 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3085  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3717  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.168673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6619  transcriptional regulator, LysR family  33.71 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.69 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3915  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.69 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.69 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2119  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  31.14 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0904041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.69 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.69 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1250  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0513927 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1291  transcriptional regulator, LysR family  30.61 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.64922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 295 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4893  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0696189  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4594  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2752  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000767643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  34.78 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2608  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1775  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310759  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1392  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0389535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>