More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0474 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  96.73 
 
 
306 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  96.41 
 
 
306 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  96.41 
 
 
306 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  96.71 
 
 
304 aa  597  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  96.41 
 
 
306 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  96.41 
 
 
306 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  96.38 
 
 
304 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  87.13 
 
 
305 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  87.46 
 
 
305 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  87.46 
 
 
305 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
326 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
326 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  86.84 
 
 
326 aa  536  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  83.22 
 
 
307 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  82.78 
 
 
305 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  79.73 
 
 
307 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  79.8 
 
 
305 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  79.33 
 
 
305 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  79.8 
 
 
316 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  77.81 
 
 
303 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  76.49 
 
 
303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  58.02 
 
 
313 aa  338  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  55.82 
 
 
295 aa  318  6e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  54.76 
 
 
295 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  51 
 
 
305 aa  316  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  57.55 
 
 
295 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  57.55 
 
 
295 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  57.55 
 
 
295 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  58.27 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  58.63 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  57.55 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  57.55 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  55.67 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  55.97 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  55.67 
 
 
295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  57.55 
 
 
298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  56.47 
 
 
295 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 
299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  56.45 
 
 
296 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
305 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  54.3 
 
 
290 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  53.95 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  48.5 
 
 
319 aa  278  7e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  52.32 
 
 
302 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
290 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  51.56 
 
 
300 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.48 
 
 
293 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  51.21 
 
 
290 aa  272  7e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  50.18 
 
 
291 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  51.67 
 
 
301 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  48.94 
 
 
306 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  48 
 
 
304 aa  242  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
301 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 
337 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
320 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  38.97 
 
 
301 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  38.97 
 
 
301 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
296 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  38.62 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  38.62 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  38.62 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  45.83 
 
 
296 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40.15 
 
 
292 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 
298 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 
307 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
295 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
302 aa  186  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
300 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.24 
 
 
300 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  39.7 
 
 
300 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  40.99 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1969  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 
308 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2332  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 
308 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.194223  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
296 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
300 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
318 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  37.38 
 
 
312 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>