More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5031 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 289 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  33.89 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4791  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  35.21 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  34.11 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6221  transcriptional regulator, LysR family  35.92 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  35.67 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4429  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 305 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  34.93 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  34.93 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  34.93 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 306 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.17 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.17 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  34.93 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3228  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 304 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.493428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3900  transcriptional regulator, LysR family  34.06 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3491  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  38.17 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.34 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2690  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.66 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  36.95 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02429  DNA-binding transcriptional activator of 3-phenylpropionic acid catabolism  32.76 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1140  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.76 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3769  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.76 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2822  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.76 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.922303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02393  hypothetical protein  32.76 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2689  DNA-binding transcriptional regulator HcaR  32.76 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00584589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1131  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 296 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.53 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3793  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  30.27 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  30.03 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  31.82 
 
 		 292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  35.66 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  35.66 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  35.66 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  35.66 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  35.66 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 296 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 326 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 326 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 326 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  33.58 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2932  DNA-binding transcriptional activator XapR  31.23 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000456471  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1340  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>