More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3044 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  50.72 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  50.36 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.09 
 
 		 293 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 291 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 290 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  44.04 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  45.29 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  43.88 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 326 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  43.68 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  43.68 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  43.68 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  43.68 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  43.68 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  43.68 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  43.68 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 296 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  42.28 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  42.28 
 
 		 295 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 296 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  42.28 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  42.28 
 
 		 295 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  41.95 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  41.95 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  41.95 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  41.95 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  42.18 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 292 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.37 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  36.92 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 298 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 296 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  35.34 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 293 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  33.33 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  33.33 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>