More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3244 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
316 aa  634    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 
307 aa  511  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 
305 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  82.78 
 
 
305 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 
326 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 
326 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  82.24 
 
 
305 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 
326 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  82.45 
 
 
305 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  80.13 
 
 
304 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  79.8 
 
 
306 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  80.46 
 
 
306 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  80.13 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  80.13 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  80.13 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  80.13 
 
 
306 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  80.13 
 
 
304 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  77.96 
 
 
305 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  76.87 
 
 
307 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  75.66 
 
 
305 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  72.28 
 
 
303 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  71.62 
 
 
303 aa  447  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 
305 aa  330  3e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 
313 aa  325  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 
310 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 
303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 
299 aa  318  9e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  56.16 
 
 
296 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 
295 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  54.11 
 
 
295 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  55.76 
 
 
296 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
296 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  52.36 
 
 
298 aa  298  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  55.4 
 
 
295 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  55.4 
 
 
295 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  55.4 
 
 
295 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  55.4 
 
 
295 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  54.32 
 
 
296 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  54.32 
 
 
296 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  54.32 
 
 
296 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  54.68 
 
 
295 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  54.68 
 
 
295 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  54.68 
 
 
295 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  54.68 
 
 
295 aa  292  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  55.36 
 
 
290 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  55.4 
 
 
296 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
319 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  55.02 
 
 
290 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  50.83 
 
 
305 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
308 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  51 
 
 
302 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 
290 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 
290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  53.33 
 
 
301 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50 
 
 
293 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
291 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  46.74 
 
 
306 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
301 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 
298 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
337 aa  208  8e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
341 aa  202  7e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 
305 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
320 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
302 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  36.81 
 
 
301 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  36.81 
 
 
301 aa  195  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  36.46 
 
 
301 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
301 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 
301 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  36.46 
 
 
301 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
296 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  36.46 
 
 
301 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 
299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 
299 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.46 
 
 
296 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  43.08 
 
 
296 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  40.84 
 
 
292 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 
298 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 
293 aa  179  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
305 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
302 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
323 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
335 aa  176  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
375 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49340  LysR family transcriptional regulator protein  38.08 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.5 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 
289 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>