More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_08760 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 306 aa  610  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  56.6 
 
 		 290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  55.9 
 
 		 290 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.1 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 291 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  48.94 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  48.94 
 
 		 306 aa  266  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 303 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  49.82 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  49.82 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  49.82 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  49.82 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  49.46 
 
 		 304 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  48.23 
 
 		 304 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 316 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  48.38 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  47.52 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 305 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  47.29 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  47 
 
 		 303 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  45.85 
 
 		 295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  44.7 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  45.12 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  45.27 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  45.12 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  45.27 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  44.93 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  44.93 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  44.93 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 298 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 296 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 296 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  46.98 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.54 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 304 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  39.49 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  38.76 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 299 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  35.87 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.1 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 307 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>