More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3771 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
296 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  96.28 
 
 
296 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  94.93 
 
 
296 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  93.58 
 
 
298 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  94.56 
 
 
296 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  84.98 
 
 
295 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  84.59 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  84.59 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  84.59 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  84.59 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  84.59 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  84.25 
 
 
295 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  84.25 
 
 
295 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  77.05 
 
 
295 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  77.4 
 
 
295 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  75 
 
 
296 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  56.25 
 
 
303 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  55.9 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
326 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
326 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
326 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  56.47 
 
 
313 aa  311  7.999999999999999e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
305 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
305 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  55.56 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  55.56 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  57.35 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  55.56 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  55.56 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  55.56 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  56.16 
 
 
305 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  56.99 
 
 
306 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  55.05 
 
 
306 aa  305  6e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  52.9 
 
 
305 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  54.32 
 
 
307 aa  295  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  54.68 
 
 
307 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  55.04 
 
 
305 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  54.32 
 
 
316 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
303 aa  278  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 
310 aa  273  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  51.71 
 
 
299 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  51.79 
 
 
308 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3827  LysR family transcriptional regulator  51.2 
 
 
304 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.645077  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
305 aa  258  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
302 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  51.09 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 
305 aa  249  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
291 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  50 
 
 
290 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  49.11 
 
 
293 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  47.9 
 
 
300 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3716  LysR family transcriptional regulator  48.91 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.294124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2203  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 
290 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2367  transcriptional regulator, LysR family  52.36 
 
 
301 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
301 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08760  Transcriptional regulator, LysR family  45.62 
 
 
306 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.139187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 
292 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
296 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  43.07 
 
 
296 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
301 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  42.7 
 
 
296 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  39.7 
 
 
302 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  36.88 
 
 
299 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
295 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  42.56 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.83 
 
 
296 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1108  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 
337 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.102258 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.59 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0395  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
298 aa  182  6e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5111  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 
297 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
296 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1196  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
320 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
301 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1313  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
341 aa  178  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000621922  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0544  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 
295 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
299 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
305 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2536  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 
297 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00700314  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 
296 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45170  Transcriptional regulator, LysR family  41.01 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  40.41 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  35.59 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  35.59 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
297 aa  172  9e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  35.25 
 
 
301 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
301 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
301 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  35.25 
 
 
301 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  35.25 
 
 
301 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 
323 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>