More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4791 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4791  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 290 aa  548  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4429  transcriptional regulator, LysR family  48.43 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.771515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4893  transcriptional regulator, LysR family  39.3 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0696189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2161  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0803244  normal  0.636405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  32.52 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 304 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3491  transcriptional regulator, LysR family  34.62 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 305 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5765  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119933  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 297 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 300 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 300 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1346  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 294 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.638115  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.7 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  32.72 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3534  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  32.43 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0417  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784631  normal  0.373184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  30.34 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  31.4 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2678  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.97 
 
 		 294 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0441451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  34.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  34.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  34.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 302 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  37.17 
 
 		 299 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  30.89 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  33.84 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2612  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.59 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0177144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2784  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.59 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00240936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  38.42 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2563  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.59 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000012261  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2654  DNA-binding transcriptional activator XapR  33.59 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00016667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  31.7 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  30.54 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  30.54 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  30.54 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  30.54 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20370  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 290 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0913088  normal  0.975596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  30.54 
 
 		 301 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 297 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  31.13 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  31.32 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6393  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  31.32 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4460  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4603  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0215938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>