More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2453 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 305 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 306 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  53.62 
 
 		 303 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3697  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 299 aa  263  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.95243  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2880  transcriptional regulator, LysR family  47.2 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  44.89 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0861  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0756  transcriptional regulator, LysR family  47.67 
 
 		 302 aa  220  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1770  transcriptional regulator, LysR family  42.61 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2583  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1674  transcriptional regulator, LysR family  40.35 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20350  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0757406  normal  0.387603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7477  transcriptional regulator, LysR family  35.89 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.286037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2719  transcriptional regulator, LysR family  39.43 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0845859  normal  0.202883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4229  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 296 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  32.89 
 
 		 289 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  30.32 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  28.21 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  29.48 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.89 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 296 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  32.62 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2097  transcriptional regulator, LysR family  31.43 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  26.95 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3167  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2879  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0719  LysR family regulatory protein  30.51 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0714085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1451  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.870434  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0532  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0137  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.750096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0550  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  26.6 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  37.23 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4734  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1685  LysR substrate binding domain protein  32.53 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.533068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1598  LysR substrate binding domain protein  32.53 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1657  LysR substrate binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1589  LysR substrate binding domain protein  32.53 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.103905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1852  LysR substrate binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1356  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal  0.0413241 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1434  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.83 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  29.43 
 
 		 299 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 302 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  29.43 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5436  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1672  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1134  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  29.66 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 317 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7097  transcriptional regulator, LysR family  32.01 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.785925  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1543  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5765  transcriptional regulator, LysR family  30.91 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119933  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0833  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>