More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7477 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7477  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 322 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.286037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  35.08 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0861  LysR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 300 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  33.44 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3697  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.95243  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2880  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2583  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0756  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1674  transcriptional regulator, LysR family  31 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20350  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0757406  normal  0.387603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4229  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1770  transcriptional regulator, LysR family  39.49 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2719  transcriptional regulator, LysR family  36.22 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0845859  normal  0.202883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  33.65 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  33.65 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  33.65 
 
 		 299 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  29.61 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.41 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.41 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5765  transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119933  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 300 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 295 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.64 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 279 aa  95.5  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1548  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  29.72 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4923  LysR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 299 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  32.68 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4734  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  32.68 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  31.9 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  31.86 
 
 		 300 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0633  transcriptional regulator, LysR family  33.63 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.127453 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3963  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1931  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.846594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  32.04 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2742  DNA-binding transcriptional regulator CynR  36.2 
 
 		 325 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0588637  normal  0.665335 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2411  transcription regulator protein  42.62 
 
 		 311 aa  90.5  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5108  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.336118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  42.52 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5862  transcriptional regulator, LysR family  43.36 
 
 		 323 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 296 aa  89.7  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2244  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1803  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1296  transcriptional regulator, LysR family  51.58 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 300 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.02 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  28.66 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3491  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  31.43 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1369  transcriptional regulator, LysR family  29.5 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>