More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1369 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1369  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  621  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0633  LysR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0640  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404969  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3249  LysR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2803  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1196  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  26.71 
 
 		 301 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  27.05 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  26.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  26.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  26.71 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  26.71 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  26.6 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.08 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0927  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1405  LysR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.893483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.74 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3900  transcriptional regulator, LysR family  29.6 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  27.11 
 
 		 299 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2482  LysR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 303 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.086853  normal  0.0180215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1342  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2876  LysR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.692087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.52 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6486  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.898531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4970  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5567  tartrate utilization transcriptional regulator  26.3 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2231  LysR family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 298 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.392595  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7065  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000862794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 300 aa  95.9  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 323 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.17 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  31.45 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2909  transcriptional regulator, LysR family  25.25 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0304015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2888  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  30.14 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.23 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2713  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.59 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7050  transcriptional regulator, LysR family  28.44 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1136  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  26.96 
 
 		 301 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5722  transcriptional regulator, LysR family  28.44 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.437697  normal  0.903757 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5705  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.02 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.202456 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5949  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.02 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233312  normal  0.638196 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5919  transcriptional regulator, LysR family  28.44 
 
 		 296 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3285  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 301 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  29.33 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  29.56 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 317 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1243  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.0485343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0038  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.744574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0037  transcriptional regulator, LysR family  29.57 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.279269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3676  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0866147  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  28.85 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2994  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0317639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4012  putative LysR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6244  transcriptional regulator, LysR family  28.44 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235646  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  28.72 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>