More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0795 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  99.37 
 
 		 317 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 317 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  99.68 
 
 		 317 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 317 aa  656    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  99.68 
 
 		 317 aa  653    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 317 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 317 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  51.52 
 
 		 297 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 297 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 297 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 297 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 297 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 306 aa  272  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  40.59 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 307 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0162  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 305 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 300 aa  245  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 322 aa  245  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 299 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5168  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 298 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2806  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3391  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.279491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4125  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0971923 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3330  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3338  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.714315  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4776  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6028  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4958  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.468232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4438  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.79 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4128  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3236  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.54 
 
 		 296 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  30.38 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  31.71 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  31.71 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  31.71 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  31.71 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 293 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  31.36 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  31.82 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 294 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3454  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 299 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  31.65 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  27.84 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3165  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000392866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 311 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>