More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2537 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2537  transcription regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2812  transcriptional regulator, LysR family  91.92 
 
 		 297 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.260123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2406  transcriptional regulator, LysR family  91.92 
 
 		 298 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  66.55 
 
 		 301 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  62.84 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 300 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  59.59 
 
 		 300 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 300 aa  341  7e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  59.25 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  59.25 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  59.25 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  56.85 
 
 		 300 aa  338  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  59.25 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 300 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  50.51 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  50.51 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  50.51 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  50.51 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  49.83 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2936  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00477843  normal  0.111677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 305 aa  265  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 308 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  48.97 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  48.97 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 308 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 308 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 309 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2261  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.54 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 307 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3479  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35259  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  37.68 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4699  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 340 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.254912  normal  0.0113206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6260  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5523  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.553864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0532  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  32.17 
 
 		 317 aa  175  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0545  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6662  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6427  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6374  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5626  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0807108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3181  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0298  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.202952 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6009  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.853275 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1911  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1817  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3393  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 298 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5168  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 314 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3391  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.279491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4776  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4125  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0971923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2806  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3330  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>