More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2583 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2583  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 308 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0861  LysR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1674  transcriptional regulator, LysR family  42.96 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  42.7 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 305 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20350  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0757406  normal  0.387603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2880  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3697  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.95243  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4229  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0756  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  31.25 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2719  transcriptional regulator, LysR family  35.87 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0845859  normal  0.202883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1770  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 270 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7477  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.286037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 321 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 289 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2500  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 297 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  28.09 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  28.09 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  28.09 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  28.09 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  31.96 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  28.09 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2897  transcriptional regulator, LysR family  31.88 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00606116  hitchhiker  0.00007682 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 309 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 305 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  33.51 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2442  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.383889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  33.16 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2198  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1110  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5916  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2161  LysR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0352  transcriptional regulator, LysR family  31.58 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5470  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000367157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2072  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  32 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2344  transcriptional regulator, LysR family  33.88 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2179  LysR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2048  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01554  hypothetical protein  32.63 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2043  transcriptional regulator, LysR family  33.7 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0607  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693427  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  25.7 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2305  transcriptional regulator, LysR family  32.63 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 300 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0157  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0640  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  25.35 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  31.44 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0038  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68920  LysR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3551  transcriptional regulator, LysR family  35.47 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3722  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 307 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3963  LysR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1527  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 303 aa  93.2  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44500  Transcriptinal regulator, LysR family  29.62 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.581761  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1982  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1870  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.89 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102903  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3007  LysR family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2312  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2330  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>