More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0861 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0861  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  593  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2583  transcriptional regulator, LysR family  48.29 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.220983 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1674  transcriptional regulator, LysR family  50.35 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2571  transcriptional regulator, LysR family  44.57 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000871152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20350  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0757406  normal  0.387603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2453  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.317953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3007  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 306 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6051  transcriptional regulator, LysR family  40.49 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4229  transcriptional regulator, LysR family  44.16 
 
 		 305 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0846  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2719  transcriptional regulator, LysR family  44 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0845859  normal  0.202883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3697  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.95243  normal  0.109394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6373  Transcriptional regulator-like protein  36.46 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0756  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2880  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.487858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1770  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7477  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.286037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2980  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2265  transcriptional regulator, LysR family  32.87 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4518  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3529  LysR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.741174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5031  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339518  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  34.34 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  34.34 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  34.34 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  34.34 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  34.34 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  34.34 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8824  transcriptional regulator, LysR family  29.75 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1585  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4639  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2328  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1888  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.282153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 292 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0394  transcriptional regulator  30.82 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.505096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3307  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2323  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 309 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0304  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1858  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.039705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.16 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1746  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2129  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0865  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1152  LysR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  34 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1027  transcriptional regulator, LysR family  32.22 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2178  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.506627  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3491  transcriptional regulator, LysR family  30.48 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2138  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 337 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0535  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.524385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0578  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2064  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.053811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5901  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0331  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.172645  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0722  LysR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 314 aa  96.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0746  transcriptional regulator, LysR family  34.87 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0855  LysR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 308 aa  95.9  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.931414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4076  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3583  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.206502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5674  transcriptional regulator, LysR family  31.63 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3071  LysR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0185768  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5843  LysR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1781  transcriptional regulator, LysR family  32.21 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  27.55 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5022  transcriptional regulator, LysR family  26.55 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.851594  normal  0.174295 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2134  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4209  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0298089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3750  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.203083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0890  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.12488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1350  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0827  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 296 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.237922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0799  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.603179  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0858  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.311751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0152  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1605  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  29.7 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2554  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0664958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  26.69 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0613  transcriptional regulator, LysR family  31.79 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.311225 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1897  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 304 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.202001  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1802  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1669  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2035  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>